Gymnadenia runei est une nigritelle apomictique, tétraploïde (2n=80), probablement issue d'une hybridation entre G. nigra (2n=60) et G. conopsea (2n=40).

La plante haute de 10 à 20 cm, porte une tige relativement robuste, anguleuse, de teinte vert clair lavé de rouge vers le sommet. L'inflorescence hemisphérique à ovoïde est composée d'un petit nombre de fleurs bien ouvertes, de teinte bordeaux à pourpre avec des reflets bleutés ou violacés. Les bords des bractées sont glabres, dépourvus de denticulation dans la partie distale. Le labelle, long de 7 à 9 mm et large de 4 à 6 mm, est grand et très ouvert pour le genre. Les sépales latéraux sont étalés. Le parfum est similaire à celui de G. conopsea.

G. runei affectionne les landes subarctiques sur substrat alcalin, entre 600 et 850 mètres d'altitude. Son aire de répartition est limitée à quelques stations situées à l'ouest du comté suédois de Västerbotten (Laponie du Sud), proche de la frontière norvégienne. Cette espèce est très rare et ses effectifs sont limités à quelques milliers d'individus. L'espèce est classée comme quasi menacée (UICN catégorie NT).

Période de floraison : début à fin juillet.